• Actualización: 16 de julio de 2020

En lo personal me gusta instalar Miniconda ya que es una versión más ligera de Anaconda, incluye python y conda, principalmente.

Para instalar en una ubicación personalizada utilizamos la opción -p del instalador.

wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
mkdir -p $HOME/bin/miniconda3
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -b -p $HOME/bin/miniconda3

Agregamos los ejecutables que viene con miniconda al $PATH

cat <<EOF >> $HOME/.bashrc

export PATH=$HOME/bin/miniconda3/bin:$PATH

EOF

Recargamos el $PATH

source $HOME/.bashrc

En terminal para obtener la información correspondiente a nuestro entorno base de conda.

conda info

Actualizamos conda a la nueva versión, si es que la hay, disponible para conda.

conda update conda

Agregamos algunos canales útiles:

cat <<EOF >> $HOME/.condarc
channels:
  - conda-forge
  - bioconda
  - r
  - defaults
EOF

Para una experiencia más rápida podemos utilizar Mamba, la cual es una reimplementación de conda en C++

conda install -yc conda-forge mamba

A partir de ahora podemos usar conda con la rapidez de mamba para instalar todos los paquetes necesarios.

mamba update --all